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La herramienta IIT Madras AI mapea los genes que causan cáncer

Cancer, AI, PIVOT, IIT Madras

Investigadores del Instituto Indio de Tecnología de Madras (IIT Madras) han desarrollado una herramienta basada en Inteligencia Artificial, PIVOT, que puede predecir los genes que causan cáncer en un individuo. Esta información temprana no solo puede ayudar a prevenir el cáncer, sino incluso diseñar estrategias personalizadas de tratamiento del cáncer.

La predicción del gen causante de cáncer se basa en un modelo que utiliza información sobre mutaciones, expresión de genes y variación del número de copias en los genes, así como perturbaciones en la red biológica debido a una expresión génica alterada.

La investigación fue dirigida por el Prof. Raghunathan Rengaswamy, Decano (Global Engagement), IIT Madras, y Profesor, Departamento de Ingeniería Química, IIT Madras, Dr. Karthik Raman, Profesor Asociado, Bhupat y Jyoti Mehta School of Biosciences, IIT Madras y un Core Miembro, Centro Robert Bosch para la ciencia de datos e inteligencia artificial (RBCDSAI), IIT Madras, y Malvika Sudhakar, becaria de investigación, IIT Madras. Los hallazgos de la investigación han sido publicado en una revista revisada por pares Frontera en Genética.

Destacando la importancia de la investigación, el Dr. Karthik Raman, miembro principal, RBCDSAI, IIT Madras, dijo: “El cáncer, al ser una enfermedad compleja, no se puede tratar con un tratamiento único para todos. A medida que el tratamiento del cáncer se desplaza cada vez más hacia la medicina personalizada, estos modelos que apuntan a señalar las diferencias entre los pacientes pueden ser muy útiles”.

La herramienta se basa en un modelo de aprendizaje automático que clasifica los genes como genes supresores de tumores, oncogenes o genes neutros. La herramienta pudo predecir con éxito tanto los oncogenes existentes como los genes supresores de tumores como TP53 y PIK3CA, entre otros, y nuevos genes relacionados con el cáncer como PRKCA, SOX9 y PSMD4.

Hablando sobre la importancia de brindar un tratamiento personalizado contra el cáncer, Malvika Sudhakar, becaria de investigación del IIT Madras, dijo: “La investigación en medicina de precisión aún se encuentra en una etapa incipiente. PIVOT ayuda a ampliar estos límites y presenta perspectivas para la investigación experimental basada en los genes identificados”.

Se sabe que los tratamientos actuales contra el cáncer son perjudiciales para la salud general del paciente. El conocimiento de los genes responsables del inicio y la progresión del cáncer en los pacientes puede ayudar a determinar la combinación de fármacos y terapia más adecuada para la recuperación de un paciente. Aunque hay herramientas disponibles para identificar genes de cáncer personalizados, utilizan aprendizaje no supervisado y predicen escenarios basados ​​en la presencia y ausencia de mutaciones en genes relacionados con el cáncer. Este estudio, sin embargo, es el primero en utilizar el aprendizaje supervisado y tiene en cuenta el impacto funcional de las mutaciones.

Los investigadores del IIT Madras han creado modelos de predicción de IA para tres tipos diferentes de cáncer, incluido el carcinoma invasivo de mama, el adenocarcinoma de colon y el adenocarcinoma de pulmón. Están planeando extenderlo aún más a muchos más tipos de cáncer. El equipo también está trabajando en una lista de genes causantes de cáncer personalizados que pueden ayudar a identificar medicamentos adecuados para los pacientes.



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Written by notimundo

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