Redacción NM
A estudio reciente del CSIR-Centro de Biología Celular y Molecular, Hyderabad, arroja luz sobre la estructura de la población de gibones hoolock occidentales (Hoolock hoolock) en la región nororiental de la India. La especie ocupa una región marcada con grandes ríos que fluyen durante todo el año y representan una barrera geográfica importante para que las poblaciones de ambos lados no se mezclen. Las perturbaciones en el paisaje causadas por los humanos han agudizado aún más el problema, dando lugar a subpoblaciones más aisladas que forman parte de una ‘metapoblación’ más amplia.
Para mapear la diversidad genética de los gibones hoolock occidentales, los académicos recolectaron muestras fecales de todo su rango geográfico. Para obtener estas muestras, se siguió de cerca a los individuos de gibón hoolock occidental durante unos días para garantizar una estrategia de muestreo sólida.
Los restos fecales son útiles porque consisten no solo en células epiteliales del intestino, sino también en restos de alimentos no digeridos. En una conversación por correo electrónico con indianexpress.com, el Dr. Govindhaswamy Umapathy, el autor correspondiente del estudio, explicó que «cuando extraemos ADN de muestras fecales, encontramos todo tipo de ADN, incluido el de los alimentos, pero solo lo amplificamos más usando primates». marcadores específicos para análisis posteriores en los que se dejará atrás el ADN de otras especies.’
El ADN fecal se ha utilizado ampliamente en el pasado para comprender la ocupación, el tamaño de la población y la dieta de una amplia gama de especies. Además, ‘los materiales alimentarios digeridos y sin digerir pueden codificarse mediante marcadores de código de barras para identificar las especies de alimentos’, añade el Dr. Umapathy. Finalmente, las muestras fecales se complementaron con muestras de sangre de gibones mantenidos en cautiverio en zoológicos de Assam y Manipur.
El estudio aprovecha el ADN mitocondrial (ADNmt) de los restos, que, a diferencia del ADN nuclear (ADNnr), es monoploide. En otras palabras, el ADNmt no existe como un par de cromosomas sino como un pequeño cromosoma circular. Dado que no se recombina como lo hace el nrDNA, se hereda ‘tal cual’ de madre a descendencia, lo que lo hace bastante susceptible a cuellos de botella demográficos como brotes de enfermedades. Estas características hacen del ADN mitocondrial un marcador molecular muy útil en estudios ecológicos.
En última instancia, es necesario cuantificar la diversidad genética dentro de las poblaciones y entre ellas. Dado que el mtDNA se hereda uniparentalmente como un solo conjunto de rasgos (también conocido como haplotipo), una buena métrica es la de «diversidad de haplotipos». En otras palabras, la diversidad de haplotipos describe el número y la diversidad de diferentes haplotipos mitocondriales. Otra métrica utilizada por Trivedi et al. (2022) fue la diversidad de nucleótidos (), que cuantifica cuán diferentes son las secuencias genéticas en promedio (una hebra de ADN no es más que nucleótidos unidos).
Finalmente, el estudio calculó las estadísticas de fijación (FST) que miden las frecuencias alélicas entre dos o más poblaciones. Un alelo es esencialmente un tipo de un gen particular, por ejemplo, para un gen que determina el color de la flor, un alelo codificará el amarillo, otro alelo el rosa y así sucesivamente. En pocas palabras, cuanto mayor sea la FST, mayor será la diferencia genética entre dos poblaciones y viceversa.
Para la metapoblación de gibones hoolock occidentales, los autores encontraron una alta diversidad de haplotipos y una baja diversidad de nucleótidos. Estos valores son, sin embargo, más altos que los de la mayoría de los primates, lo que ‘sugiere una historia evolutiva compleja… con múltiples casos de cuellos de botella y diversificación… los ríos y otras barreras geográficas en esta región podrían haber influido en la alta diversidad de haplotipos y baja diversidad de nucleótidos en el oeste. gibones hoolock.
El estudio identifica tres subpoblaciones con 27 haplotipos. La subpoblación del ‘sur’ aparentemente tiene un continuo genético con sus contrapartes en Bangladesh. La subpoblación ‘norte’ está formada por personas de partes de Meghalaya, Assam (Tinsukia y Hollongapar) y Arunachal Pradesh (Roing). Las muestras recolectadas de Wakro, Arunachal Pradesh, forman una tercera subpoblación distinta.
Los cálculos de FST muestran un valor bastante alto entre todas las poblaciones (es decir, Norte-Sur, Sur-Wakro, Norte-Wakro), lo que implica un alto nivel de diferenciación genética y un flujo de genes limitado entre todas ellas. Los autores teorizan que esto probablemente se deba al sistema fluvial que divide la región y evita que las poblaciones de gibones hoolock occidentales se mezclen entre sí.
Sin embargo, el estudio señala que estas poblaciones son estables y resistentes a la fragmentación del hábitat y que su trabajo permitirá una intervención más específica en los esfuerzos de conservación.
El autor es investigador en el Instituto Indio de Ciencias (IISc), Bangalore, y comunicador científico independiente. Él tuitea en @critvik.
