Redacción NM
La subvariante Omicron BA.2.75 altamente transmisible se detectó por primera vez en India y luego en otros diez países, según la Organización Mundial de la Salud (OMS). Aún no se ha determinado si es clínicamente grave o no, pero los estudios preliminares aquí muestran una enfermedad leve, dice el Dr. Rajesh Karyakarte a Anuradha Mascarenhas.
¿Por qué Dr. Rajesh Karyakarte?
Como profesor y jefe del departamento de microbiología en el BJ Medical College and Sassoon General Hospital (BJGMC), administrado por el gobierno, en Pune, el Dr. Karyakarte también es coordinador de secuenciación del genoma en Maharashtra. Como científico clave en la red de laboratorios del Consorcio de Genómica del SARS-CoV2 de la India, analiza los resultados y los informa al Centro Nacional para el Control de Enfermedades y al gobierno de Maharashtra. Fue como parte de este proyecto de secuenciación del genoma que los científicos pudieron brindar información concluyente sobre la detección de mutaciones de las variantes Delta y Kappa en febrero y Omicron a mediados de diciembre del año pasado. El equipo ahora está seleccionando las subvariantes BA.2.38 a BA.2.74, BA.2.75 y BA.2.76.
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El virus parece estar en continua evolución y, además de la mutación presente en BA.2, los tres, BA.2.74, BA.2.75 y BA.2.76 han tenido mutaciones adicionales en su genoma que codifica proteínas de punta. Estas tres subvariantes han tenido más de nueve cambios en la proteína espiga y están escapando de la inmunidad adquirida.
Justo cuando estábamos viendo una disminución en las infecciones de Covid-19, luego de un aumento impulsado principalmente por la variante Omicron a principios de este año, ha habido una tendencia al alza con las nuevas subvariantes como BA.2.74, BA.2.75 y BA.2.76 tomando el control
Fue desconcertante encontrar que el número de variantes BA.2 seguía aumentando a pesar de un retroceso de la tercera ola de Covid-19. Obtuvimos números iguales de BA.2 y BA.2.38 en nuestras ejecuciones de secuenciación. Además, estos dos fueron los más dominantes incluso después de la introducción de BA.2.12.1, BA.4 y BA.5 en el panorama de variantes del SARS-CoV-2 de la India, a diferencia de otros países. Estas variantes más alarmantes no estaban ganando números. Después de coordinar la secuenciación de 35 103 muestras en BJGMC, Pune, quedó claro que después de una gran ola de BA.2, no se esperaba en absoluto un aumento causado por un BA.2 no mutado. Sin embargo, todas las canalizaciones bioinformáticas siguieron identificando BA.2 en grandes cantidades. Esto estaba debilitando nuestra respuesta epidemiológica ya que no se pueden delinear grupos de infecciones. Por lo tanto, se planteó la necesidad de segregar BA.2 en Pango Network, lo que llevó a nombrar los nuevos linajes: BA.2.74, BA.2.75 y BA.2.76. Tras reevaluar los BA.2 previamente identificados, se observa que casi la mitad pertenecen a estos tres linajes. Este hallazgo ayudará a identificar nuestra respuesta epidemiológica a la pandemia de Covid-19. Se espera una clasificación adicional de BA.2 pronto. Es importante señalar que estas tres variantes ya formaban parte del BA.2 identificado en la oleada actual.
¿Fue el laboratorio de secuenciación de BJGMC, Pune, el primero en identificar y alertar los aislamientos de SARS-CoV-2 identificados como BA.2.74, BA.2.75 y BA.2.76 en India?
Los científicos de Pango Network encontraron mutaciones únicas en los genomas del SARS-CoV-2 cargados en GISAID por científicos indios. Por lo tanto, para un mejor rastreo epidemiológico, se sugirieron nuevos linajes para estos aislamientos. Sin embargo, las subvariantes de Omicron también se encuentran en otras partes del mundo. El laboratorio de secuenciación de BJGMC, Pune, fue el primero en identificar y señalar con bandera roja los aislamientos de SARS-CoV-2 identificados como BA.2.74, BA.2.75 y BA.2.76 en India. Hemos identificado 45 como BA.2.74, 14 como BA.2.75 y 21 como BA.2.76 a partir del 7 de julio. Estas son principalmente variantes de BA.2 que han evolucionado con mutaciones añadidas además de las del padre (BA.2) .
La mayoría de la población ha sido inmunizada contra el Covid-19. ¿Cuál es la eficacia de la vacuna contra estas subvariantes emergentes?
BA.2 jugó un papel importante en la tercera ola de Covid-19 en India. La mayor parte de la población de la India está inmunizada contra el virus debido a su exitoso programa de vacunación. Además, las tres oleadas significan que la mayoría de las personas han estado expuestas a una inmunidad mediada por una vacuna o por una infección. Por lo tanto, para infectar a esa población, el virus necesita evadir la inmunidad. Los anticuerpos contra las proteínas de punta de superficie del SARS-CoV-2 protegen a una persona contra la infección. Las mutaciones pueden cambiar la forma de ciertas partes de las proteínas de pico, lo que hace que los anticuerpos desarrollados después de la vacunación o la infección sean ineficaces. Esto conduce a una reinfección/infección avanzada.
El virus está en continua evolución y, además de la mutación presente en BA.2, estos tres, BA.2.74, BA.2.75 y BA.2.76, han tenido mutaciones adicionales en su genoma que codifica proteínas de punta. Estas tres subvariantes han tenido más de nueve cambios en la proteína espiga y están impulsando el aumento de las infecciones por covid. Dos mutaciones, G4465 y R493Q, son los cambios clave en BA.2.75. Estos han sido identificados esta semana, por lo que los estudios son esenciales para determinar la efectividad de la vacuna contra estas subvariantes emergentes. Sin embargo, dado que estas nuevas subvariantes se detectan en pacientes positivos para RT-PCR en el aumento actual, su potencial de escape inmunitario ya está establecido.
Se están reportando casos de BA.4 y BA.5 pero sus números aún no se han disparado. ¿Tus vistas?
En cuanto a las variantes alarmantes, BA.2.12.1, BA.4 y BA.5, sus números aún no se han disparado. Una estrecha vigilancia por secuenciación es esencial. Además, el papel de BA.2.38 y estas tres nuevas subvariantes: BA.2.74, BA.2.75 y BA.2.76 2 en la reducción de los números de BA.2.12.1, BA.4 y BA.5 debe ser juzgado. Es esencial observar de cerca, mediante secuenciación, los números de BA.2.75, ya que tiene nueve mutaciones más además de las de su padre, BA.2.
¿Estas nuevas subvariantes causarán una forma más grave de infección?
Nuestros estudios clínicos anteriores en BJGMC, Pune, mostraron que Omicron causó infecciones leves y las tasas de hospitalización fueron bajas. También habíamos realizado un estudio similar con respecto al sublinaje AY.4 de Delta durante la segunda ola. Nuestro estudio del sublinaje codominante BA.2.38 mostró que los resultados clínicos fueron similares a los de nuestro estudio anterior sobre Omicron. Hemos realizado un estudio clínico preliminar de 75 pacientes con infección BA.2.74, BA.2.75 y BA.2.76 y descubrimos que la mayoría tenía síntomas leves. Ninguno requirió oxígeno y no hubo muertes.
Durante el monzón, puede haber una mezcla de diferentes virus (dengue/chikungunya/ H1N1). Entonces, ¿cómo se distingue entre Covid, que se comporta como la gripe estacional, y otras infecciones respiratorias?
Todos los virus causan fiebre. Las pruebas de diagnóstico microbiológico distinguen fácilmente estas infecciones virales. Así, una prueba serológica/RT-PCR específica para estos virus (dengue, chikungunya y H1N1) identifica fácilmente estas infecciones virales.
